本系成立於 1976 年，次年成立研究所碩士班，1983 年成立博士班，隨著電機電子領域之快速茁壯，配合國內、外高科技產業之需求，特於 1996 年和 1999 年分別成立 電子工程研究所 及 通訊工程研究所 碩、博士班。

1998 年，本系與資訊系合作，共組電機資訊學院，以進行人力、資源之整合與密切交流，迎接電子資訊時代的全面來臨。

2003 年成立 光電工程研究所 碩、博士班。電機系仍設有碩士班與博士班，分為電力組與系統組。

除了各個研究所之外，亦成立了數個先進的 研究中心：像是 積體電路設計技術研發中心、先進電源科技中心、電腦與通訊研發中心、多媒體科技研發中心、先進快閃記憶體中心。